서울대학교 음악대학에서 발행하는 학술지인 『음악이론연구』는 국내 음악학계의 대표적인 학술지로 한국연구재단의 등재지이다. 1992년 창간호를 시작으로, 음악사, 음악이론, 분석, 미학, 비평, 뇌인지, 교육 등 음악학의 모든 분야를 다루고 있으며, 국내외 음악학자들의 연구 성과 교류의 중심 역할을 하고 있다.